反流性食道炎多和胃炎有一定的关系，治疗多需要联合用药。胃炎容易诱发胃内气体增加出现食道反流，而胃内容物中的胃酸，可以损伤食道黏膜出现反流性食道炎。
可以用奥美拉唑或者雷尼替丁等药物减少胃酸的分泌，用硫糖铝凝胶或次碳酸铋等药物，在消化道黏膜上形成一个保护层，减少食道内黏膜的进一步损伤。
可以用多潘立酮或莫沙必利等药物，促进胃肠道的正向运动，减少胃内容物出现食道反流。
还可以进一步做碳13或者碳14吹气试验，看看是否有幽门螺杆菌感染，有幽门螺杆菌感染时，加用克拉霉素和黄连素等药物做抗感染治疗。