直肠息肉通过肛门指诊、肛门镜或者电子肠镜发现以后，必须进行手术治疗。绝大多数的早期直肠息肉多数属于单一的良性息肉或者良性的多发性直肠息肉。发现和确诊以后，需要患者尽早进行相关的手术治疗，一般采用电子肠镜下直肠息肉切除手术，或者通过肛门口直接将直结肠息肉、直肠息肉进行切除，避免直肠息肉进一步生长而出现恶变。如果直肠息肉在发现时本身体积偏大或者怀疑有恶变，切除以后还需要将切除下来的息肉离体组织做进一步的病检，来明确病理性质。
直肠息肉的发生和患者不良的排便习惯、生活习惯有一定的关系，建议患者在手术切除以后养成长期良好的饮食习惯、排便习惯。直肠息肉切除以后，需要半年到一年复查一次电子肠镜，如果患者有明显的家族遗传病史，则需要连续复查多次，直肠息肉患者在切除后的早期需要流质饮食。