判断肛门狭窄可以通过患者的病史，也就是症状，结合医生查体，同时使用器械检查或者是影像学检查综合判断。症状和体征主要就是排便时大便变细，或者是彻底堵塞的狭窄，不能排出大便，引起肠梗阻的症状。
查体可以通过肛门视诊，观察肛门不能扩张，同时通过直肠指诊，可以触及肛门环有局部的瘢痕挛缩，不能通过指头造成肛门狭窄，也可以通过肛门镜检查，进一步取病理活检，明确肛门狭窄的具体原因。