小儿疱疹性咽颊炎多由于孩子年龄小、抵抗力弱，容易受细菌和病毒的侵袭，而引起感冒、发烧、上呼吸道感染、急性咽炎、急性扁桃体炎。在这时候可以口服抗生素和口服抗病毒口服液，同时让孩子口服中成药，如蒲地蓝消炎口服液、抗病毒口服液来清热去火、对症治疗。
如果急性咽炎反复发作就会引起慢性咽炎出现间腔黏膜淋巴滤泡增多，出现咽部的不适感，孩子会经常有痰液，喜欢吐痰，喜欢清嗓子，在这个时候需要淡盐水漱口，口服中成药来清热去火及对症处理。