脚内侧骨头突出、疼痛，可能是以下原因导致：一、由此处长期受到挤压导致，足部的内侧本身就有正常突起，此处如果长期受到挤压、摩擦，就可能导致此处皮肤出现相应炎症，继而产生疼痛，比如患者长期穿鞋过紧或者长期做摩擦到此部位的动作，就会引起上述症状；二、可能由此处的骨质增生导致，常见于此处长期受凉或者有陈旧性的损伤，导致这个部位过度骨质增生，造成此处骨头突出，并且刺激周围的皮肤引起疼痛；三、可能为平足症导致，出现平足症时不仅会有足弓的塌陷，而且可能在足内侧有过度骨性突起，继而压迫此处皮肤，刺激此部位的神经，从而导致疼痛。