新型冠状病毒肺炎的主要症状有发热、乏力、干咳，部分严重病例可以于发病一周后，出现不同程度的呼吸困难及低氧血症，严重者可以急性进展为急性呼吸窘迫综合征、脓毒症休克，部分患者以嗅觉、味觉减退或丧失为首发症状，少数患者可以出现鼻塞、流涕、咽痛、肌痛等症状，还可以以消化系统症状为首发症状，表现为腹泻、腹痛、恶心、呕吐，腹泻每日3-5次，为黄色稀便。部分新型冠状病毒肺炎的患者可以出现结膜炎症状，可以有眼红、眼痛、眼痒、眼分泌物明显增加。
发热是新型冠状病毒肺炎主要的临床表现，是由于新型冠状病毒病毒血症所引起，发热体温高低与感染新型冠状病毒病毒株的强弱、感染新型冠状病毒病毒量多少，以及机体免疫功能密切相关。发热患者通常体温在37.5-38℃，大部分患者体温在39℃，严重时体温可以达到40℃，部分重型、危重型患者及年老体弱的患者，病程中没有明显发热，甚至仅有低热。