农药中毒的患者通常会留有一定程度的后遗症，但是随着农药中毒的时间延长，后遗症会逐渐减轻，如果及时进行治疗，后遗症也会相对较少。常见后遗症有消化系统的症状，例如恶心、反酸、烧心、呕吐、食欲减退、进食量减少，或油腻饮食过后会出现反胃、腹痛等不同程度的后遗症。对于循环系统，患者时常会出现胸闷、气短、心悸、心前区不适，劳累过后心前区会明显出现疼痛感的症状加重。另外，神经系统的后遗症相对较多，患者会出现如迟发性脑病，或严重时会引起下肢瘫痪、四肢肌肉萎缩，都属于农药中毒的后遗症。