霉菌性阴道炎是在全身以及阴道局部免疫能力下降的情况下，霉菌大量繁殖，才会得霉菌性阴道炎。霉菌性阴道炎的致病菌为阴道假丝酵母菌，又称为白色念珠菌，这是一个条件致病菌。10%-20%的非孕妇女，以及30%的孕妇阴道中，都有这个细菌的寄生，但是菌量极少，呈酵母状，并不引起症状。
只有在全身以及阴道局部免疫力下降，尤其是局部细胞免疫力下降的情况下，假丝酵母菌大量繁殖就会引起阴道炎的症状，表现为霉菌性阴道炎。常见的发病诱因主要有妊娠、糖尿病，以及大量应用免疫抑制剂和广谱抗生素，都会诱发霉菌性阴道炎的产生。其他的诱因有胃肠道的假丝酵母菌，也就是胃肠道里本身也有霉菌的存在，胃肠道假丝酵母菌的繁殖也可能会诱发霉菌性阴道炎的发生。再有含有高剂量雌激素避孕药的使用，以及穿紧身的化纤内裤、肥胖，肥胖可以使会阴局部的温度、湿度增加，从而假丝酵母菌容易繁殖，可以引起感染。