有些抗体对身体有益，有些抗体对身体不利，而且可以引起自身免疫性疾病。通常对身体有益的一些抗体，是针对各种病原微生物感染产生的抗体，此类抗体再接触到病原微生物可起到保护作用。另外，有些抗体是通过注射疫苗所产生保护性抗体，此类抗体通常对身体有益，而且对再次接触病原微生物可起到综合作用，防止机体再次感染病原微生物。
但也有一些抗体对身体非常不利，比如对自身某些蛋白产生抗体，例如抗核抗体、平滑肌抗体、线粒体抗体，上述抗体通常对自身一些蛋白成分产生了不应该出现的抗体。此类抗体和抗原成分反应之后，可以引起自身免疫性疾病，此类抗体对身体非常不利。所以抗体本身对机体有好的一面，但如果对自身蛋白产生了抗体，也有非常不利的一面。