女性肝囊肿最常见的就是先天性的肝囊肿，原因是因为胚胎时期肝内胆管或者淋巴管发育异常而引起的，其他的原因是获得性肝囊肿，包含创伤性、炎症性、寄生虫性引起的囊性病变，更多的原因是见于男性患者。
此外，还有多囊肝的病变，多囊肝是属于遗传性的病变，常见于女性，症状也更为明显，因为女性以及雌激素都是多囊肝进展的危险因素，所以女性肝囊肿的病因是多样化的，最常见的就是先天性肝囊肿。
如果囊肿较小的时候没有任何症状，不需要特殊处理，只需要定期复查，随访即可。但如果囊肿过大，引起相应的压迫症状时，则需要考虑进一步的治疗。