鼻窦囊肿分为黏液囊肿、黏膜囊肿和发生于上颌骨的牙源性囊肿。黏液囊肿为鼻窦口的长期闭塞，窦内分泌物潴留而形成。黏膜囊肿是窦黏膜的黏液腺或者浆液腺管口堵塞，腺体分泌膨胀而形成，上述两类可采取手术切除并建立鼻窦和鼻腔的引流。
牙源性囊肿分含牙囊肿和牙根囊肿，前者多发生于青年，是牙发育异常引起的。后者由牙根尖、肉芽肿退行性变形成，多发于年龄较大的病人。其治疗为同时摘除囊肿、处理牙病，可以和口腔外科联合行手术治疗。