吃完榴莲后头疼可能与榴莲的致热作用等相关，中医理论认为榴莲性热，可以活血散热，改善腹部寒凉的症状。对于血管来说，有抗动脉粥样硬化的作用，对于脑部的血管可以改善供血。
榴莲果肉中含有含硫的化合物，可以激活与中医理论辛味药性相关的受体，起到调节温感的作用。头部疼痛多与脑血管等相关，如动脉粥样硬化以及当脑部血管扩张时，可能会出现头部疼痛的情况。所以吃完榴莲后头疼，是其致热作用以及血管舒张的作用引起相关头痛的发生。