经皮肾镜碎石取石术，是比较常见的一种治疗肾结石以及输尿管上段结石的手术方式。手术费用主要还是与医院所处的省份，以及医院的医疗等级相关，目前全国都在推广按单病种收费。
如果是在三级甲等医院就诊，治疗肾结石如果采用经皮肾镜碎石取石术，医疗费用大约是在31000块钱左右。这是单病种治疗的费用标准，具体的治疗费用可能还会与患者的病情，以及是否出现术后并发症等因素相关。
如果患者的肾结石本身就比较大，可能一次手术并不能完全解决所有的结石，需要二次手术，这个治疗费用自然就会升高。如果术中、术后出现并发症，需要延长住院时间，也会导致住院费用的上升。