房间隔膨出瘤的诊断标准主要依赖心脏彩色多普勒超声进行，超声诊断标准主要包括二维超声心动图下房间隔局限性的瘤突入一侧心房，或者是在两房间进行摆动，成人诊断标准包括膨出度＞10mm，基底直径＞15mm，小儿诊断标准包括左房横径或右房横径膨出度＞25%，此时就可以诊断房间隔膨出瘤。
房间隔膨出瘤的诊断标准依赖于心脏彩色超声进行，很多小的房间隔膨出瘤并没有引起明显的血流动力学异常，病人常不伴有特殊的临床症状，只是做心脏超声检查其他疾病时才发现房间隔膨出瘤的存在。房间隔膨出瘤主要在心脏超声下心脏结构有些异常，若没有合并症，主要靠超声心动图检查确定诊断。