肾囊肿手术如何做，根据囊肿的不同性质来进行决定。如果是单纯性的肾囊肿，当直径＞5cm的时候，而且证实是良性的囊肿，只需要在B超引导下做穿刺抽液处理，可以在适当的时候注入硬化剂，防止囊肿重新出现。如果这个囊肿是单纯性的囊肿，但是可能存在恶性病变的可能，经过肾脏强化CT，证实存在恶性病变，就需要泌尿外科做相应的手术处理，切除囊肿或者相应的肾脏组织。
如果囊肿是由于多囊肾造成的，多囊肾是遗传性疾病，所以囊肿有大有小，而数目不等、多少不一。所以碰见这种囊肿，都需要仔细的评估是否需要做相应手术。因为多囊肾囊肿如果做了相应的手术，有可能造成感染、出血，持久不愈。所以多囊肾肾脏囊肿一般不行手术处理，只需要动态观察。本身多囊肾的囊肿就容易发生自发性破裂、自发性感染，以及自发性的出血，在这种情况下就不需要主动做囊肿的手术。