卵巢畸胎瘤最好的治疗方法要根据卵巢畸胎瘤的大小以及是否出现并发症来进行治疗，具体如下：
第一、如果多半是怀疑畸胎瘤，主要是进行超声检查得出了一个推测性的结论，怀疑畸胎瘤直径在1-2cm，甚至2-3cm之内，这种畸胎瘤如果肿瘤标志物都是正常的，或者经过核磁共振检查以后发现畸胎瘤就是单纯的成熟畸胎瘤，可以动态的观察，如果短期内长大，还要进行手术治疗。
第二、卵巢畸胎瘤的直径超过5-6cm，这种需要即刻做手术，因为可能会发生蒂扭转，甚至是哪一天发生了破裂，就会成为一个急腹症，会给生活带来非常大的不便，需要定期做手术治疗。