男科和泌尿科的区别，通常是在于男科主要是诊治男性的性功能方面，或者跟生育方面相关的疾病，而泌尿外科通常是处理常见的泌尿、男性器官、生殖系统相关的疾病，比如常见的肿瘤、结石、前列腺增生、异物、泌尿系统损伤、结核、感染、畸形等这类疾病，通常要在泌尿科就诊。
对于男科性功能障碍或者精子的异常、男性的前列腺系统疾病，通常在男科的诊治比较多。有时两个科没有明确的界限，需要根据医生的选择以及病人情况来具体进行分析。