女性尖锐湿疣同男性尖锐湿疣相比，比较难治。因为女性有正常的生理周期，当月经期时，体内雌激素和孕激素水平增高，会促使尖锐湿疣的复发。
此外，女性尖锐湿疣都是因为阴道具有潮湿的环境，合并有阴道炎，如果不积极治疗阴道炎，尖锐湿疣就容易反复发作。所以治疗女性的尖锐湿疣应该首先治疗阴道炎，当阴道清洁、干燥，尖锐湿疣也就不容易再复发，所以女性尖锐湿疣不是特别好治。