手指、脚趾关节疼痛可能有以下几种原因：
第一、痛风，痛风严重时可以累及多个关节，特别是手指、脚趾的小关节常受累，这时可以出现关节的疼痛，同时可以伴有肿胀、皮肤的红肿、皮温的升高，严重者会有痛风石的形成，这时要早期的进行血尿酸的化验，来进行早期的诊断和早期的治疗；
第二、风湿和类风湿，风湿和类风湿也可以累及人体多个关节，特别是类风湿患者常以手脚的小关节疼痛为主要的表现，可以在晨起时疼痛加重，这时要进行X线片检查以及血的化验，来进行早期的诊断和早期的治疗；
第三、强直性脊柱炎，强直性脊柱炎严重时也可以累及手指、脚趾的关节疼痛，这时要进行血的化验以及手脚的X线片、CT以及骶髂关节、腰椎的X线片检查，来进行诊断和治疗。