对于生殖器疱疹检查诊断的问题，疱疹病毒感染的表现比较典型，不需要做任何检查，通过典型临床表现，有经验的医生的双眼就能够给出准确的诊断。要是局部表现不是很典型，可以做局部疱疹病毒抗原，也就是从生殖期局部，最好是在水泡的部位或者有糜烂的部位，在该部位取标本。
用棉签反复擦拭以后，做疱疹病毒一型和二型的抗原检测，是比较准确的一种检测方法。除了可以帮助诊断局部是不是有疱疹病毒以外，还可以帮助鉴别病毒是一型还是二型感染，型别的鉴定对于疱疹的预后比较有帮助。
还有一种方法是测血液里面的疱疹病毒的抗体，由于阳性率不是很高，不是非常推荐作为常规的检测。但是在女性需要怀孕之前可以做疱疹病毒抗体检测，来帮助判断是不是有近期疱疹病毒感染。