女性肛门癌早期的症状主要表现为有时患者不明显或者肛门部位有瘙痒、不适感，肛门周围会有小的乳头状或肿块生长。患者早期会出现排便习惯改变、排便次数增加、里急后重甚至排便不尽感。
有时误认为是痔疮，但经过药物治疗等症状并未明显改善，通常建议患者取病变组织活检做病理检查能够给予明确诊断，从而指导临床治疗。
女性肛门癌通常与HPV感染有关，尤其是高危型HPV16、18型感染，会引起细胞的恶性转化，例如其他的因素也有相关性，吸烟与女性肛门肿瘤关系比较密切，免疫抑制与肛门鳞状细胞癌的危险性增加也有一定关系，肛交、性传播性疾病等也与肛门癌有一定关系。
因此建议患者若有症状要及时就医，避免不良的生活习惯和不良的因素，防止疾病发生。