非淋球菌性尿道炎如果没有其他并发症，一般口服药物即可，通常选择阿奇霉素、多西环素等大环内酯类的药物，其他还可以选择的药物有红霉素、琥乙红霉素、左氧氟沙星、美满霉素、莫西沙星等。
非淋球菌性尿道炎的病原体主要以沙眼衣原体或支原体为主，其余为滴虫、单纯疱疹病毒、白色念珠菌、包皮大肠杆菌等，主要是通过性接触传播，比淋球菌性尿道炎发病率要高，因此也是属于一种性病。目前在性传播疾病中占第一位，通常在感染后1-5周发病，典型表现为尿道刺痒、尿痛，并且分泌少量白色稀薄的液体，要注意在治疗的同时配偶或者性伴侣应该同期进行检查，如果也有感染应该一起治疗，并注意性生活的卫生。