做扁桃体的手术时间一般是在30分钟左右，现在扁桃体的切除手术，主要是在全麻下用低温等离子射频消融术。在做手术的过程中，边切扁桃体可以边止血，所以会节省很多时间。
一侧扁桃体一般在10分钟以内，可以完整切除同时进行充分的检查。没有活动性出血，然后再同法切除另一侧，一般20分钟可以完成。术后需要观察五分钟，检查伤口是否有活动性出血。如果检查伤口干净清洁，没有出血，可以完成手术。手术时间一般在30分钟以内，或者20分钟以内。