生化妊娠HCG的数值会升高，大于5IU/L，但不会升的太高，在停经5周内HCG数值不超过1000IU/L，低于相同孕周的HCG检测数值，生化妊娠患者的体内HCG数值存在很大差异。
在生化妊娠后14天左右，只要宫腔内没有组织残留HCG的数值会降到正常水平，生化妊娠指胚胎没有成功着床而发生流产。在受精卵形成后可以少量分泌HCG，HCG的大量分泌主要依靠胚胎滋养层细胞，在着床成功后分泌量增加且出现隔日翻倍现象。生化妊娠的胚胎没有着床成功，滋养层细胞分泌激素量较少，导致体内HCG的数量偏低。