女性生殖系统最常见的良性肿瘤是子宫肌瘤，它是由子宫平滑肌组织增生而形成的一种良性肿瘤，主要发生在生育年龄的妇女。在妇女绝经之后，往往停止生长，以至萎缩。发生在卵巢的良性肿瘤，主要是浆液性囊腺瘤和黏液性囊腺瘤。
此外，在卵巢的生殖细胞肿瘤当中，成熟畸胎瘤属于良性肿瘤，这种成熟畸胎瘤绝大多数是囊性，所以也称为成熟囊性畸胎瘤，成熟囊性畸胎瘤有一定的恶变几率。发生在输卵管的良性肿瘤也有很多种，主要腺瘤样瘤相对比较多见，其它的还包括乳头状瘤、血管瘤、平滑肌瘤、脂肪瘤等。