食管癌的好发部位与其病理分型密切相关，不同的病理分型好发部位不同，现具体分析如下：
第一、若是食管鳞状细胞癌，常好发于食管中段、下段1/3处。食管鳞状细胞癌是食管癌中最常见的组织学类型，也是我国最常见的恶性肿瘤之一。食管鳞状细胞癌的发病率具有显著的区域性和种族性，我国太行山南部、南非、巴西南部是食管癌的高发区，而欧美国家发病率相对较低，男性患者多于女性，50岁以上多见。一般认为饮酒、吸烟、营养失衡、过热饮食，以及亚硝胺、人乳头状瘤病毒等与鳞状细胞癌的发生有关系。
第二、若是食管腺癌，绝大部分发生于食管下1/3处，存在于Barrett食管黏膜的近端边缘，也可以发生在食管的中、上1/3处，但是非常罕见。食管腺癌主要起源于食管下段的Barrett食管，好发于白色人种、老年男性人群，食管腺癌的发病率已超过当地的鳞状细胞癌的发病率，而亚洲和非洲国家食管癌腺癌非常少见。