颅咽管瘤二次手术的风险与第一次手术差不多，总体比首次手术的风险略微高些。因为已经做过一次手术，手术通路和肿瘤位置会有粘连存在，会增加手术风险。首先这个手术需进行开颅，在手术过程中可能对脑组织造成牵拉和损伤，从而引起颅内出血，术后有感染的可能。此外颅咽管瘤主要位于鞍区，这个位置的手术可能损伤到视神经和视交叉，出现视力下降甚至失明、视野缺损的情况。还有可能损伤垂体，使手术后内分泌紊乱，损伤到嗅神经出现术后嗅觉丧失。最主要的是做完手术后仍会有残留风险较高，因为第一次手术没有切干净，第二次手术就更难切除干净，所以手术后还会出现复发。