输卵管堵塞的原因主要有两个：
第一、炎症，主要是由输卵管炎症以及输卵管周围的炎症，包括卵巢炎以及盆腔结缔组织炎蔓延到输卵管，引起输卵管黏膜的功能发生改变，甚至发生积水，引起堵塞，这样输卵管就没有捡卵以及输送受精卵的能力，所以引起不孕。
第二、可能跟前面一个也有关系，是由于炎症使输卵管的运动功能减弱而引起的异位妊娠，90%的宫外孕是在输卵管里，由于治疗以后，比如输卵管的切除或者结扎，胚胎切除以后进行缝合，这样也可能引起输卵管堵塞，失去了捡卵和输送胚胎的功能，输卵管堵塞也是引起不孕症的一个主要原因。