卵巢囊肿是否严重与位于哪一侧，也就是在左侧还是在右侧没有关系。卵巢囊肿的严重程度是根据卵巢囊肿的性质来决定的，较为常见的卵巢囊肿是卵巢生理性囊肿。
卵巢生理性囊肿是在体检时发现的，平时没有明显的临床症状，在月经的后半期发现卵巢有囊性肿物，要考虑有卵巢生理性囊肿的可能，建议在2-3个月经周期之后，在月经刚刚结束的时候进行超声复查，如果超声复查发现卵巢囊肿缩小或者消失，考虑为卵巢的生理性囊肿。卵巢生理性囊肿是由于卵巢激素水平波动所造成的，这种情况是不严重的，大多数不需要治疗。
还有一种是卵巢子宫内膜异位囊肿，也就是巧克力囊肿，巧克力囊肿是造成女性痛经依据不孕等的常见病因，因此对于卵巢子宫内膜异位囊肿，要进行积极的随访和治疗。