肾病是一种免疫系统疾病，所以需要用免疫抑制剂来治疗。免疫抑制剂种类很多，主要有糖皮质激素、环磷酰胺、吗替麦考酚酯，以及钙调磷酸酶抑制剂。如果患者肾病较轻，特别是病理类型表现比较轻的肾病，例如微小病变或者早期膜性肾病，可以单独应用免疫抑制剂，例如糖皮质激素、钙调磷酸酶抑制剂。
如果患者肾病表现比较重，应用一种免疫制剂无法产生良好的治疗效果，就需要联用另外一种免疫抑制剂，常联用的是环磷酰胺。环磷酰胺是一种常见的免疫抑制剂，可以抑制B细胞等淋巴细胞产生过多的细胞因子，使机体失衡的免疫系统恢复正常。环磷酰胺的应用一般三个月才开始起效，如果超过六个月不起效，说明患者对环磷酰胺不敏感。