通常AFP检查就是甲胎蛋白的检测，属于临床上经常会检测的一种肿瘤相关标志物。而甲胎蛋白是人类认识比较早，有临床价值的原发性肝癌和生殖细胞肿瘤的肿瘤标志物。大概有80%原发性肝癌患者的血清中可以检测到甲胎蛋白的升高，其中的50%患者可以检测到高浓度的甲胎蛋白。
在一些良性的肝脏疾病，比如肝炎、肝硬化病人的血清当中，也可以检测到甲胎蛋白的增高，但绝大多数会甲胎蛋白＜200μg/L的水平。如果将甲胎蛋白和绒毛膜促性腺激素联合应用，还可以用于精原细胞瘤的分型和分期的诊断。