金樱根酸，涩，归肾，膀胱，大肠经，有固精缩尿，涩肠止泻作用。肾主生殖，藏精，肾虚会导致精关不固引起遗精，可用本品熬水或跟菟丝子共同使用。肾阳虚会导致尿频、夜尿增多，金樱根有缩尿的功效，可跟益智仁、山药共用。
脾肾阳虚会导致白带增多且无异味，金樱根有止带的作用，可跟芡实共同使用。肾虚也会导致小便浑浊，金樱根可以跟芡实配合使用。金樱根善于涩肠止泻，治疗脾肾阳虚引起的腹泻不止。慢性痢疾引起的腹痛、腹泻、赤白黏冻，金樱根可以配伍米可壳同用。