葡萄膜炎的原因根据发病机理，可以是内因性和外因性两种。内因性的葡萄膜炎主要是以自身免疫性疾病导致，也就是自身免疫功能的紊乱，出现葡萄膜的炎症反应。
外因性的比如眼睛的眼外伤、手术，比如内眼手术，包括青光眼、白内障或者眼底视网膜手术，手术创伤也可以伴随有葡萄膜炎症反应。所以，原因简单分为内在原因和外在原因这两个部分。