小肠炎会出现腹痛、腹泻、恶心、呕吐、全身症状，小肠部位出现炎症时症状表现多种多样，不同程度的小肠炎症表现出来的临床症状也会不同。
小肠炎症会引起患者出现腹部疼痛，症状较轻时会出现大便次数增多、水样大便，症状严重会导致便血，频繁的腹泻会引起肠道痉挛、腹部疼痛。小肠炎症会引起肠运动亢进，食物进入小肠后推进速度比较快，食物还没完全消化，大量水分就已进入大肠，所以会导致患者出现腹泻。
肠炎还会导致胃肠道功能紊乱，所以患者会合并不爱吃东西，进食后出现恶心、呕吐等表现。经常腹泻会导致身体免疫力下降，此时会出现发热、无力、全身不适等症状。