幽门螺杆菌检查能喝水，可以少量的喝白开水。要求是空腹做检查，但是饭后2个小时以后也可以做该项检查，不会影响检查的结果，所以少量的喝水也没有关系。幽门螺杆菌的检查方法首选的是碳13或碳14呼气试验，该项检查方法为无创伤性的检查，而且不需要行电子胃镜，所以比较容易接受。
如果受检查者选择做的是抽静脉血查幽门螺杆菌抗体，也可以喝水，不过该检测结果不是很准确，所以比较提倡的是做呼气试验。存在有幽门螺杆菌感染的患者，需要在专科医生的指导下酌情给予药物治疗幽门螺杆菌，具体的需要咨询专科医生。