患者出现一侧扁桃体疼痛，常提示存在急性炎症感染，可以吃抗生素类及有清热解毒效果的中成药物进行联合治疗，比较常用的包括阿莫西林胶囊、头孢丙烯片、盐酸左氧氟沙星片等，中成药物包括蓝芩口服液、喉咽清口服液、六神胶囊等，也可以在咽喉部使用含片和喷剂类药物，比如西吡氯铵含片、咽立爽口含滴丸、活性银离子喷剂等。
如果患者一侧扁桃体疼痛症状较剧烈，甚至造成张口受限、吞咽和进食困难，可能提示出现了扁桃体周围炎、扁桃体周围脓肿。此时单纯口服药物治疗常难以有效控制，需要采取输液，进行抗炎、抗感染治疗。如果扁桃体局部形成明显的周围脓肿，可能需要采取切开引流或穿刺抽脓处理。患者若出现一侧扁桃体明显疼痛，最好首先到医院进行详细检查以明确诊断。