下肢静脉血栓时，常用的治疗药物分为抗凝治疗药物和消肿药物。抗凝治疗药物又分为三种：
第一种是最常见的皮下注射低分子量肝素，通过皮下注射后组织吸收，从而影响改变抗凝的时间。
第二种药物是口服用药，包括传统的口服药物华法林以及新型口服药物达比加群，利伐沙班等。
第三种是静脉给的抗凝溶栓药物，分为外周静脉和直接导管溶栓。需要通过外周静脉或者溶栓导管泵入肝素、尿激酶、蚓激酶等药物，达到溶栓治疗的作用。
而另外一种传统意义上的消肿药物，如马栗种子提取物、羟苯磺酸钙胶囊、地奥司明片，是通过口服药物后促进下肢静脉回流，减轻下肢静脉压力，改善静脉微循环，预防血栓后综合征的出现。