生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的，导致生殖器疱疹的病毒主要分为单纯疱疹病毒Ⅰ型以及单纯疱疹病毒Ⅱ型，大多数的生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒Ⅱ型导致的。
它的症状在发疹前数个小时或者五日前有前驱症状，主要表现局部瘙痒、烧灼感、刺痛、隐痛，然后男性在龟头、冠状沟、阴茎，女性在大小阴唇、阴道口、肛周出现簇集状的小水疱，2-4天后破溃，形成糜烂和溃疡。
一般持续4-10天，然后结痂愈合，局部可以出现瘙痒、疼痛或者烧灼感，有的会有尿道炎、膀胱炎或者宫颈炎的表现，腹股沟的淋巴结可能会肿大、有压痛。