精子畸形率高会影响怀孕。精子化验，正常形态的精子要占到4%左右。如果正常形态的精子小于1%，畸形的精子约99%，这种情况怀孕的可能性要明显的降低。建议一定要查清楚畸形精子到底有多少，如果不大于96%，则是一种正常的。因为精子是不断的产生、排出、成熟，只要一次射出的精子正常的占到3%-4%，则是正常范围，一般都可以正常怀孕，太高则容易导致怀孕的可能性明显降低。