肛裂的严重程度不同，治疗原则不同。急性肛裂以保守治疗为主，止痛、止血，防止出现疼痛恶性循环。慢性肛裂、陈旧性肛裂，以手术治疗为主，彻底消除肛裂的病因及加剧疼痛的因素。保守治疗方法为保持大便柔软通畅，防止便秘，多吃蔬菜水果，增加饮水。可口服缓泻剂润肠通便，局部温水坐浴可松弛肛门括约肌，改善局部血液循环，减轻疼痛，以利于创口愈合。局部药物治疗有：
一、止痛类药物，麻醉药、非甾体类抗炎药物可以减轻疼痛的症状。
二、促进裂口愈合类，比如痔疮膏或者一些促进生长的药膏等。
三、0.2%的硝酸甘油软膏涂于肛裂处，具有抑制神经递质，而且有松弛平滑肌、扩张血管的作用，可使内括约肌松弛，肛管压力下降，改善局部血液循环。
对经久不愈、保守治疗无效的慢性肛裂可采用手术治疗，将肛裂及其周围病变组织全部切除，使其成为新鲜创面，再行愈合。肛裂需要外用药膏时，一定要在医生的指导下使用。