真菌性鼻窦炎手术大不大要根据患者病变的分型决定，临床上有以下的分型：一、患者是非侵袭性的真菌性鼻窦炎，手术可以做鼻内镜下鼻窦开放手术，将窦口开放，将窦腔内的真菌团块冲洗掉、清除掉就可以了，对于窦壁的黏膜和骨质可以保留，手术不是很大。二、如果患者是侵袭性的真菌性鼻窦炎，手术由于病变侵犯了窦腔的黏膜和骨质，手术就比较大了，手术的过程之中，不仅需要做窦口的开放引流，需要将窦内的病变清除掉。对于已经受累的黏膜和骨质也需要进行处理，所以手术是比较大的，而且手术术后容易复发，术后还需要进行抗真菌的治疗。