乳糖不耐受和牛奶蛋白过敏的区别如下：
1、乳糖不耐受是因肠道内各种原因导致乳糖酶分泌减少、乳糖酶缺乏而导致母乳或者牛乳中的乳糖不能够得到有效分解和消化，使乳糖在肠道内发酵形成乳酸，刺激肠道运动而导致腹泻、大便次数增多，呈水样便、泡沫便，甚至蛋花汤便。宝宝会有腹胀、哭闹、不安，甚至有肠绞痛的情况，少数的小孩可能会有恶心、呕吐的表现。在治疗上一方面可用无乳糖、去除乳糖的治疗方法，另一方面可增加乳糖酶的治疗；
2、牛奶蛋白过敏是婴儿体内免疫系统对牛奶蛋白产生过度免疫反应，而造成的一种过敏反应，消化系统表现是漾奶、吐奶、聚奶，甚至腹泻、黏液便，甚至严重者会有血丝便以及顽固性便秘等。牛奶蛋白过敏主要是规避治疗，规避所有含有牛奶蛋白成分的可疑食物，无论是牛奶、奶制品都要规避，一般规避3-6个月。这种情况下可以用特殊的配方奶粉，轻度可以用适度水解奶粉，轻到中度或中到重度者可能要用氨基酸奶粉，需要根据病情选择特殊配方奶粉以及母亲饮食回避等。