慢性功能性便秘也叫原发性便秘，是指各种原因导致胃肠道动力紊乱而出现的便秘，诊断慢性功能性便秘，需要除外器质性便秘，需要完善相关检查，以除外全身系统性疾病，以及胃肠道局部疾病导致的便秘，慢性功能性便秘的分型，包括出口梗阻型便秘、慢传输型便秘以及混合型便秘。
出口梗阻型便秘往往会表现为排便不尽感以及排便费力，通过肛管直肠测压可以明确诊断，往往需要进行生物反馈才能治疗。而慢传输型便秘往往是无便意、排便时间延长、大便干结呈粪球状，往往需要综合性的治疗，包括生活方式的调理以及缓泻药的使用，必要时还可以加用刺激类泻药。所以慢性功能性便秘可以分为慢传输型便秘、出口梗阻型便秘以及混合型便秘。