大黄蛰虫丸最主要的副作用即为皮疹、经量增多，及经期延长。大黄蛰虫丸为中成药，其主要功效为活血化瘀、通经消痞，在妇科方面可用于治疗女性月经量少、闭经、月经紊乱、盆腔炎性包块、潮热、消瘦等。由于该药的主要成分为熟大黄、土鳖虫、水蛭等，所以有少数敏感体质者，可能在用药后出现皮疹、红斑、皮肤瘙痒等类似过敏的症状，此时应及时停药，选择其他的治疗方式。
该药还有较强的活血作用，女性用药后就可能会出现阴道不规则出血、月经量增多、月经淋漓不尽等情况，如出血量大、时间长，则可能诱发贫血，是否能够继续用药，应根据患者自身情况来判断。服药时也应注意避免进食辛辣、刺激食物，以及饮酒等，以免加重药物副作用。