医院体检时，艾滋病是自愿检查项目，如果不主动要求体检，一般的检查不包括艾滋病检查。如果患者要求检查艾滋病，会进行艾滋病的特异性抗体检测，HIV病毒进入人体之后，会刺激机体的免疫反应，产生相对应的抗体，抗体产生之后会持续存在，所以，如果检测到HIV特异性抗体，可以作为诊断HIV病毒感染的依据。
如果是已经确诊的艾滋病人感染者，就不需要再检查HIV特异性抗体，但需要定期检查HIV核酸、CD4+T淋巴细胞以及CD4与CD8的比值，尤其是在抗病毒治疗期间，要定期进行HIV核酸检测来监测抗病毒治疗的疗效。通过HIV核酸检测可以确定机体内HIV病毒的载量，CD4+T淋巴细胞检测可以判断机体的免疫状态，通常在艾滋病的急性期时，CD4+T淋巴细胞会降至350个/mm^3以下，在艾滋期时，可能会降至200个/mm^3以下，尤其是CD4与CD8的比值<1时，说明机体的免疫状态有缺陷。