前列腺炎的物理疗法主要包括生物反馈治疗以及热疗。研究表明，慢性前列腺炎患者存在盆底肌的协同失调，或者是尿道外括约肌的紧张，因此生物反馈合并电刺激治疗可以使盆底肌松弛，并使之趋于协调，同时松弛外括约肌，从而缓解慢性前列腺炎的会阴部不适以及排尿症状。生物反馈治疗要求患者通过生物反馈治疗仪主动参与治疗，该疗法无创伤，可以作为选择性的治疗方法。
热疗主要是利用多种物理手段所产生的热效应，增加前列腺组织的血液循环，加速新陈代谢，有利于消炎和消除组织水肿、缓解盆底肌肉痉挛等等。有经尿道、经直肠以及经会阴途径，可以应用微波、射频、激光、磁疗等等物理手段进行热疗，短期内会有一定的缓解症状的作用，不过缺乏长期的随访资料，对于未婚未育一般不推荐使用。