卵巢良性畸胎瘤最常见的并发症就是畸胎瘤的扭转和破裂，因为卵巢良性畸胎瘤有的时候长的比较快，甚至长的比较大，有可能会发生破裂，发生破裂了之后肚子里就会出现严重的腹痛。如果破裂正好在血管上，就会出现大出血。
还有卵巢畸胎瘤因为内部成分不均一，有的时候是脂肪，有的时候有头发，有牙齿、头皮，导致了重心不稳定，所以卵巢良性畸胎瘤还有一个并发症就是肿瘤的扭转。卵巢囊肿、蒂扭转也会发生急腹痛，属于急腹症的一种，病人会出现剧烈的腹痛，伴大汗淋漓，必要的时候有可能需要切除单侧卵巢。还有卵巢良性畸胎瘤可能会影响卵巢的功能，所以可能会导致月经的延迟，甚至月经不来，有的时候还会影响排卵功能导致不孕。