婴儿肠炎主要是由于以下几种因素引起：1、发生肠炎的内在因素，因为婴儿的年龄比较小，肠道的酶活性比较低，肠道中免疫蛋白的活性比较差，这是引起儿童发生肠炎的内在体质基础。2、由于感染病毒引起，如果婴儿经过呼吸道传播感染了轮状病毒，就会引起病毒性肠炎。3、由于婴儿平时吃手比较多，又没注意手部的卫生，会将细菌等病原菌进入到儿童的消化道中，也会引起婴儿发生肠炎。