骨结核最常见的发病部位是脊柱，其中以椎体结核占大多数，附件结核十分罕见。椎体以松质骨为主，滋养动脉为终末端，结核杆菌容易停留在椎体部位。在整个脊柱中，腰椎活动度最大，腰椎结核发生率也最高，胸椎次之，颈椎更次之，至于骶尾骨结核则十分罕见。患者多数为儿童，30岁以上的患者发病率会明显下降。
椎体结核可以分为中心型和边缘型两种，中心型椎体结核多见于10岁以下儿童，好发于胸椎，病变进展速度较快，整个椎体会被压缩成楔形，一般只侵犯一个椎体，也有穿透间盘而累及邻近椎体。边缘型椎体结核多见于成人，腰椎为好发部位，病变局限于椎体的上下缘，很快会侵犯椎间盘和相邻的椎体，椎间盘破坏是本病的特征，椎间隙会明显狭窄。