卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜移位到卵巢上，当来月经期间移位的子宫内膜会脱落出血形成巧克力囊肿，如果囊肿比较小，在正常备孕的情况下怀孕了，怀孕期间异位的子宫内膜有可能坏死，卵巢巧克力囊肿可以自愈的。但是如果没有备孕的打算，没有怀孕，卵巢巧克力囊肿有可能逐渐增大，就必须手术切除治愈。手术的方式可以选择腹腔镜微创手术，在皮肤上打3-4个洞，由特殊的仪器将卵巢囊肿切除，对身体的损害性小恢复快，手术之后还需要应用药物，比如亮丙瑞林或者戈舍瑞林肌注3-6个月的时间，降低卵巢囊肿的复发率。